Hae:

Oulun yliopiston väitöskirjat

PROTEIN CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A-TIM—STRUCTURE BASED DEVELOPMENT OFNEW ENZYMES, ACTA UNIVERSITATIS OULUENSIS A Scientiae Rerum Naturalium 547

ISBN-13:	978-951-42-6122-0
Kieli:	englanti
Kustantaja:	Oulun yliopisto
Oppiaine:	Luonnontieteet
Painosvuosi:	2010
Sidosasu:	pehmeäkantinen
Sijainti:	Print Tietotalo
Sivumäärä:	196
Tekijät:	SALIN MIKKO

20.00 €

Entsyymit voivat toimia ylivoimaisina katalyytteinä monissa kemianteollisuuden prosesseissajohtuen niiden hyvästä spesifisyydestä, valikoimiskyvystä, alhaisesta energiantarpeesta ja ympä-ristöystävällisyydestä. Näistä ominaisuuksista huolimatta entsyymien kaikkien mahdollisuuksi-en hyödyntämisen esteenä on monia haasteita. Tarvittavia ominaisuuksia ovat katalyyttinentehokkuus, saatavuus suurina määrinä, alhainen hinta, alhainen tuoteinhibitio sekä korkea aktii-visuus ja stabiilisuus prosessiolosuhteissa. TIM-tynnyrirakenne on yleisin ja monipuolisin proteiinien laskostumisrakenne luonnossaesiintyvissä entsyymeissä. Tässä rakenteessa katalyyttisesti aktiiviset aminohappotähteet ovatsijoittuneet tynnyrirakenteen toiselle puolelle, kun taas stabiilisuuden kannalta tärkeät amino-happotähteet ovat sijoittuneet kokonaan toiselle puolelle. Tämä erityinen rakenne antaa mahdol-lisuuden muokata proteiinin katalyyttistä aktiivisuutta vaikuttamatta haitallisesti sen stabiilisuu-teen. Tämä on täydellinen lähtökohta proteiininmuokkaukselle. Tässä tutkimusprojektissa käytettiin ns. järkiperäistä suunnittelua monomeerisen trioosifos-faatti-isomeraasivariantin (A-TIM) luomisessa. Tämän tutkimustyön pääasialliset tavoitteet oli-vat (i) uusien sitoutujien löytäminen ja (ii) uuden, suuremman sitoutumistaskun ominaisuuksienmäärittäminen röntgenkristallografisilla menetelmillä. Tässä tutkimuksessa havaittiin, että A-TIM kykenee sitomaan yhdisteitä, jotka ovat täysinerilaisia luonnolliseen substraattiin verrattuna. Tässä tutkimuksessa kuvaillaan kolmenlaisiasitoutujia: (i) todelliset villityypin entsyymin substraattianalogit, (ii) substraattianalogit, joihinon liitetty hydrofobinen hiilivetyketju ja (iii) villityypin substraattia suuremmat sokerifosfaatit.Tämän lisäksi A-TIM:n aktiivisen keskuksen todistettiin olevan toimintakykyinen. Yleisellä tasolla tämä tutkimus osoittaa röntgenkristallografisten menetelmien tärkeyden ent-syymienmuokkausprojekteissa, joissa entsyymivarianttien ominaisuuksien määritys on tärkeää.

Takaisin